16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2515 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010683  Rpic_4972  hypothetical protein  92.62 
 
 		 420 aa  821    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990538  normal  0.205743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2515  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  872    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17861  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4729  hypothetical protein  39.15 
 
 		 423 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1072  hypothetical protein  38.03 
 
 		 423 aa  286  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0463115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3721  hypothetical protein  33.41 
 
 		 425 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631382 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4707  hypothetical protein  36.03 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1965  hypothetical protein  33.17 
 
 		 423 aa  192  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35800  hypothetical protein  32.03 
 
 		 438 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149745  decreased coverage  5.600339999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3060  hypothetical protein  32.03 
 
 		 438 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0050  hypothetical protein  30.47 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2297  hypothetical protein  30.2 
 
 		 420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.500408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2716  hypothetical protein  27.48 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.382449  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3370  hypothetical protein  26 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.660681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2194  hypothetical protein  24.59 
 
 		 419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0710  hypothetical protein  23.45 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000886213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1494  hypothetical protein  25.13 
 
 		 370 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>