18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2297 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2297  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  868    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.500408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4729  hypothetical protein  32.69 
 
 		 423 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1072  hypothetical protein  31.57 
 
 		 423 aa  186  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0463115  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4972  hypothetical protein  29.46 
 
 		 420 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990538  normal  0.205743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2515  hypothetical protein  30.2 
 
 		 420 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17861  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4707  hypothetical protein  32.09 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3721  hypothetical protein  30.05 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1965  hypothetical protein  29.31 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35800  hypothetical protein  25.54 
 
 		 438 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149745  decreased coverage  5.600339999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3060  hypothetical protein  25.54 
 
 		 438 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0050  hypothetical protein  25.59 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3370  hypothetical protein  28.08 
 
 		 409 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.660681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2716  hypothetical protein  26.9 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.382449  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2194  hypothetical protein  24.88 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1494  hypothetical protein  24 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09610  hypothetical protein  26.15 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385464  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0710  hypothetical protein  26.57 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000886213  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0223  hypothetical protein  41.67 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000729578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>