17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_35800 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_35800  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  917    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149745  decreased coverage  5.600339999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3060  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  917    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0050  hypothetical protein  53.72 
 
 
443 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3721  hypothetical protein  38.3 
 
 
425 aa  292  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.631382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1965  hypothetical protein  37.44 
 
 
423 aa  277  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24813  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4972  hypothetical protein  33.72 
 
 
420 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990538  normal  0.205743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2515  hypothetical protein  32.03 
 
 
420 aa  189  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17861  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1072  hypothetical protein  33.18 
 
 
423 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0463115  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4729  hypothetical protein  31.18 
 
 
423 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597904  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4707  hypothetical protein  32.1 
 
 
347 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2297  hypothetical protein  25.71 
 
 
420 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.500408  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3370  hypothetical protein  26.56 
 
 
409 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.660681  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2716  hypothetical protein  26.17 
 
 
415 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.382449  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2194  hypothetical protein  27.21 
 
 
419 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0710  hypothetical protein  26.57 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000886213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1494  hypothetical protein  21.48 
 
 
370 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09610  hypothetical protein  23.12 
 
 
402 aa  47.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>