16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3370 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3370  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  853    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.660681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2716  hypothetical protein  53.58 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.382449  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2515  hypothetical protein  26 
 
 		 420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17861  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4972  hypothetical protein  26 
 
 		 420 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990538  normal  0.205743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2297  hypothetical protein  28.08 
 
 		 420 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.500408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3721  hypothetical protein  24.07 
 
 		 425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631382 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4729  hypothetical protein  25.4 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1965  hypothetical protein  25.36 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35800  hypothetical protein  26.56 
 
 		 438 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149745  decreased coverage  5.600339999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3060  hypothetical protein  26.56 
 
 		 438 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1072  hypothetical protein  23.34 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0463115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0050  hypothetical protein  26.76 
 
 		 443 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2194  hypothetical protein  26.17 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4707  hypothetical protein  24.72 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0599  hypothetical protein  24.12 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3679  hypothetical protein  25.19 
 
 		 366 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>