17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2716 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2716  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  869    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.382449  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3370  hypothetical protein  53.58 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.660681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2515  hypothetical protein  27.48 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17861  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4972  hypothetical protein  27 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990538  normal  0.205743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3721  hypothetical protein  24.71 
 
 		 425 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2297  hypothetical protein  27.12 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.500408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1965  hypothetical protein  25.91 
 
 		 423 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4729  hypothetical protein  24.83 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1072  hypothetical protein  25.52 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0463115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35800  hypothetical protein  26.17 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149745  decreased coverage  5.600339999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3060  hypothetical protein  26.17 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2194  hypothetical protein  25.6 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0050  hypothetical protein  25.55 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4707  hypothetical protein  25.72 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1494  hypothetical protein  28.12 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3679  hypothetical protein  26.79 
 
 		 366 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4083  hypothetical protein  20.87 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>