21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1494 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1494  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  762    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0223  hypothetical protein  23.76 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000729578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3679  hypothetical protein  27.37 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0710  hypothetical protein  25.89 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000886213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2297  hypothetical protein  24 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.500408  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0050  hypothetical protein  23.83 
 
 
443 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3060  hypothetical protein  21.48 
 
 
438 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35800  hypothetical protein  21.48 
 
 
438 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149745  decreased coverage  5.600339999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0599  hypothetical protein  27.63 
 
 
375 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2716  hypothetical protein  28.12 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.382449  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2194  hypothetical protein  26.86 
 
 
419 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275179 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4972  hypothetical protein  20.89 
 
 
420 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990538  normal  0.205743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4729  hypothetical protein  29.44 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597904  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1966  hypothetical protein  20.06 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000115453  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1965  hypothetical protein  22.44 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24813  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2515  hypothetical protein  25.13 
 
 
420 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17861  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1072  hypothetical protein  28.81 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0463115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4083  hypothetical protein  23.68 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1047  hypothetical protein  27.72 
 
 
410 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0736  hypothetical protein  25.3 
 
 
361 aa  43.1  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2298  hypothetical protein  19.55 
 
 
345 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>