22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2194 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2194  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  867    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1072  hypothetical protein  26.16 
 
 
423 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0463115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3721  hypothetical protein  25.58 
 
 
425 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.631382 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4972  hypothetical protein  23.63 
 
 
420 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990538  normal  0.205743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2515  hypothetical protein  24.59 
 
 
420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17861  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1965  hypothetical protein  25.41 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24813  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0050  hypothetical protein  27.36 
 
 
443 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4729  hypothetical protein  25.35 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597904  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2297  hypothetical protein  24.88 
 
 
420 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.500408  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35800  hypothetical protein  27.21 
 
 
438 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149745  decreased coverage  5.600339999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3060  hypothetical protein  27.21 
 
 
438 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2716  hypothetical protein  25.6 
 
 
415 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.382449  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3370  hypothetical protein  26.17 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.660681  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0710  hypothetical protein  29.65 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000886213  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4707  hypothetical protein  20.23 
 
 
347 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1432  hypothetical protein  25.65 
 
 
411 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1494  hypothetical protein  26.86 
 
 
370 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0171  hypothetical protein  21.39 
 
 
290 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000544812  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0600  hypothetical protein  23.32 
 
 
381 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2089  hypothetical protein  25.37 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000268475  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0223  hypothetical protein  24.34 
 
 
349 aa  43.9  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000729578 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0279  hypothetical protein  20.07 
 
 
373 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>