39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1966 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1966  signal peptide protein  100 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.874063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2366  putative signal peptide protein  97.14 
 
 		 210 aa  340  9e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.369629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2164  signal peptide protein  76.67 
 
 		 210 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0709272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4367  putative lipoprotein  44.83 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11568  normal  0.560371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4257  putative lipoprotein  44.83 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.14352 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0889  hypothetical protein  39.32 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1953  hypothetical protein  36.8 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000297307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1281  hypothetical protein  41.46 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000955438  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2533  hypothetical protein  41.51 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1039  hypothetical protein  41.46 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000138687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0126  hypothetical protein  41.46 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000293987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1769  hypothetical protein  41.46 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4138  hypothetical protein  39.06 
 
 		 281 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.955129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1798  hypothetical protein  42.04 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0851898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0984  hypothetical protein  36.45 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295093  normal  0.1274 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1777  hypothetical protein  42.04 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1025  hypothetical protein  36.45 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0546  hypothetical protein  36.45 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0901  hypothetical protein  39.81 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1412  hypothetical protein  35.45 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0889401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4670  hypothetical protein  35.79 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574881  hitchhiker  0.00992931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2789  putative signal peptide protein  38.1 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0031715  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1452  hypothetical protein  35.45 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02585  putative lipoprotein  38.92 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143555  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1715  putative signal peptide protein  42.14 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1662  putative signal peptide protein  36.67 
 
 		 242 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0955  putative exported lipoprotein  35.86 
 
 		 237 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833398  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1506  hypothetical protein  34.39 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212232  hitchhiker  0.0000144009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1050  hypothetical protein  34.39 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1530  hypothetical protein  34.39 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1723  hypothetical protein  35.68 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0130536  hitchhiker  0.0000757016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0718  putative exported lipoprotein  37.84 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.261936  normal  0.297451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3032  putative exported lipoprotein  34.81 
 
 		 243 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338968  decreased coverage  0.00314115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2329  hypothetical protein  36.09 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.09763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6346  hypothetical protein  35.29 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2317  putative lipoprotein  30.71 
 
 		 258 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.927495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2694  hypothetical protein  30.71 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2208  hypothetical protein  29.01 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4717  hypothetical protein  25.54 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0538703  normal  0.011152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>