39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0889 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0889  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0901  hypothetical protein  98.15 
 
 
216 aa  427  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4138  hypothetical protein  89.32 
 
 
281 aa  344  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.955129  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0984  hypothetical protein  84.72 
 
 
232 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295093  normal  0.1274 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1025  hypothetical protein  84.72 
 
 
232 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0546  hypothetical protein  84.72 
 
 
232 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0955  putative exported lipoprotein  56.52 
 
 
237 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833398  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3032  putative exported lipoprotein  50.9 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338968  decreased coverage  0.00314115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2789  putative signal peptide protein  55.56 
 
 
242 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0031715  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1662  putative signal peptide protein  52.19 
 
 
242 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0718  putative exported lipoprotein  51.87 
 
 
247 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.261936  normal  0.297451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1715  putative signal peptide protein  51.87 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1412  hypothetical protein  44.71 
 
 
235 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0889401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1452  hypothetical protein  44.71 
 
 
235 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1953  hypothetical protein  43.35 
 
 
243 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000297307  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1769  hypothetical protein  43.35 
 
 
237 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117921  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0126  hypothetical protein  43.35 
 
 
237 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000293987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1039  hypothetical protein  43.35 
 
 
237 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000138687  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1281  hypothetical protein  43.35 
 
 
243 aa  157  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000955438  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4670  hypothetical protein  42.79 
 
 
233 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574881  hitchhiker  0.00992931 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1777  hypothetical protein  42.86 
 
 
237 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1798  hypothetical protein  42.86 
 
 
237 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0851898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1506  hypothetical protein  43.43 
 
 
236 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212232  hitchhiker  0.0000144009 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1530  hypothetical protein  43.43 
 
 
236 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1050  hypothetical protein  43.43 
 
 
236 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2533  hypothetical protein  43.92 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1723  hypothetical protein  46.46 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0130536  hitchhiker  0.0000757016 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4367  putative lipoprotein  48.72 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11568  normal  0.560371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4257  putative lipoprotein  48.72 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.14352 
 
 
-
 
NC_003296  RS02585  putative lipoprotein  47.09 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143555  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6346  hypothetical protein  38.35 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1966  signal peptide protein  42.07 
 
 
210 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.874063  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2329  hypothetical protein  48.6 
 
 
237 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.09763  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2366  putative signal peptide protein  41.98 
 
 
210 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.369629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2164  signal peptide protein  40.8 
 
 
210 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0709272  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2208  hypothetical protein  33.55 
 
 
252 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4717  hypothetical protein  33.52 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0538703  normal  0.011152 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2694  hypothetical protein  33.75 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2317  putative lipoprotein  28.97 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.927495  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>