39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2533 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2533  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  484  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1953  hypothetical protein  91.77 
 
 
243 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000297307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1281  hypothetical protein  91.36 
 
 
243 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000955438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0126  hypothetical protein  91.14 
 
 
237 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000293987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1769  hypothetical protein  91.14 
 
 
237 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1039  hypothetical protein  91.14 
 
 
237 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000138687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1798  hypothetical protein  91.56 
 
 
237 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0851898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1777  hypothetical protein  91.56 
 
 
237 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1412  hypothetical protein  60.42 
 
 
235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0889401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4670  hypothetical protein  60.42 
 
 
233 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574881  hitchhiker  0.00992931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1452  hypothetical protein  60 
 
 
235 aa  269  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1723  hypothetical protein  62.34 
 
 
236 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0130536  hitchhiker  0.0000757016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1506  hypothetical protein  59.5 
 
 
236 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212232  hitchhiker  0.0000144009 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1530  hypothetical protein  59.5 
 
 
236 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1050  hypothetical protein  59.5 
 
 
236 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1715  putative signal peptide protein  50.89 
 
 
223 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1662  putative signal peptide protein  44.64 
 
 
242 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2789  putative signal peptide protein  45.73 
 
 
242 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0031715  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0955  putative exported lipoprotein  43.23 
 
 
237 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833398  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0889  hypothetical protein  43 
 
 
216 aa  151  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3032  putative exported lipoprotein  41.82 
 
 
243 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338968  decreased coverage  0.00314115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0718  putative exported lipoprotein  43.46 
 
 
247 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.261936  normal  0.297451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4138  hypothetical protein  46.7 
 
 
281 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.955129  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1025  hypothetical protein  47.88 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0546  hypothetical protein  47.88 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0984  hypothetical protein  47.88 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295093  normal  0.1274 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0901  hypothetical protein  43 
 
 
216 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4367  putative lipoprotein  50.31 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11568  normal  0.560371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4257  putative lipoprotein  50.31 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.14352 
 
 
-
 
NC_003296  RS02585  putative lipoprotein  46.47 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143555  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2329  hypothetical protein  53.4 
 
 
237 aa  115  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.09763  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6346  hypothetical protein  36.65 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1966  signal peptide protein  42.07 
 
 
210 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.874063  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2366  putative signal peptide protein  41.46 
 
 
210 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.369629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2164  signal peptide protein  35.59 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0709272  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4717  hypothetical protein  30.48 
 
 
247 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0538703  normal  0.011152 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2208  hypothetical protein  30.26 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2317  putative lipoprotein  29.41 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.927495  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2694  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>