39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1412 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1412  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0889401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1452  hypothetical protein  99.57 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4670  hypothetical protein  85.53 
 
 		 233 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574881  hitchhiker  0.00992931 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1530  hypothetical protein  87.66 
 
 		 236 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1506  hypothetical protein  87.66 
 
 		 236 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212232  hitchhiker  0.0000144009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1050  hypothetical protein  87.66 
 
 		 236 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1723  hypothetical protein  84.62 
 
 		 236 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0130536  hitchhiker  0.0000757016 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1953  hypothetical protein  60.42 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000297307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1281  hypothetical protein  60.42 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000955438  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2533  hypothetical protein  59.5 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1039  hypothetical protein  60.26 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000138687  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1769  hypothetical protein  60.26 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117921  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0126  hypothetical protein  60.26 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000293987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1777  hypothetical protein  60.26 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1798  hypothetical protein  60.26 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0851898  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1715  putative signal peptide protein  51.12 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1662  putative signal peptide protein  47.83 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2789  putative signal peptide protein  45.19 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0031715  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0955  putative exported lipoprotein  44.98 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833398  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3032  putative exported lipoprotein  42.55 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338968  decreased coverage  0.00314115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0889  hypothetical protein  49.13 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0984  hypothetical protein  49.39 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295093  normal  0.1274 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1025  hypothetical protein  49.08 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0546  hypothetical protein  49.08 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4138  hypothetical protein  48.78 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.955129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0718  putative exported lipoprotein  45.34 
 
 		 247 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.261936  normal  0.297451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0901  hypothetical protein  45.71 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4367  putative lipoprotein  47.83 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11568  normal  0.560371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4257  putative lipoprotein  47.83 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.14352 
 
 
-
 
NC_003296  RS02585  putative lipoprotein  47.93 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143555  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2329  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.09763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6346  hypothetical protein  33.94 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2366  putative signal peptide protein  38.36 
 
 		 210 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.369629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1966  signal peptide protein  38.36 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.874063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2208  hypothetical protein  36.42 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4717  hypothetical protein  32.11 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0538703  normal  0.011152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2164  signal peptide protein  33.33 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0709272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2317  putative lipoprotein  27.49 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.927495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2694  hypothetical protein  27.49 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>