39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0718 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0718  putative exported lipoprotein  100 
 
 
247 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.261936  normal  0.297451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0955  putative exported lipoprotein  57.48 
 
 
237 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833398  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3032  putative exported lipoprotein  55.51 
 
 
243 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338968  decreased coverage  0.00314115 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0984  hypothetical protein  54.55 
 
 
232 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295093  normal  0.1274 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1025  hypothetical protein  54.07 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0546  hypothetical protein  54.07 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4138  hypothetical protein  50.21 
 
 
281 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.955129  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0889  hypothetical protein  50.93 
 
 
216 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0901  hypothetical protein  51.4 
 
 
216 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2789  putative signal peptide protein  59.76 
 
 
242 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0031715  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1662  putative signal peptide protein  45.9 
 
 
242 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1715  putative signal peptide protein  57.4 
 
 
223 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1953  hypothetical protein  43.88 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000297307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4670  hypothetical protein  45.3 
 
 
233 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574881  hitchhiker  0.00992931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2533  hypothetical protein  52.94 
 
 
243 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0126  hypothetical protein  43.46 
 
 
237 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000293987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1281  hypothetical protein  43.46 
 
 
243 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000955438  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1039  hypothetical protein  43.46 
 
 
237 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000138687  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1769  hypothetical protein  43.46 
 
 
237 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117921  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1452  hypothetical protein  45.34 
 
 
235 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1412  hypothetical protein  45.34 
 
 
235 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0889401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1777  hypothetical protein  43.46 
 
 
237 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1798  hypothetical protein  43.46 
 
 
237 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0851898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1530  hypothetical protein  52.07 
 
 
236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1506  hypothetical protein  52.07 
 
 
236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212232  hitchhiker  0.0000144009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1050  hypothetical protein  52.07 
 
 
236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1723  hypothetical protein  45.04 
 
 
236 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0130536  hitchhiker  0.0000757016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6346  hypothetical protein  44.51 
 
 
238 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02585  putative lipoprotein  41.82 
 
 
248 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143555  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4257  putative lipoprotein  42.07 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.14352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4367  putative lipoprotein  42.07 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11568  normal  0.560371 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2329  hypothetical protein  43.64 
 
 
237 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.09763  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4717  hypothetical protein  34.64 
 
 
247 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0538703  normal  0.011152 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2208  hypothetical protein  34.76 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1966  signal peptide protein  39.02 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.874063  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2366  putative signal peptide protein  37.8 
 
 
210 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.369629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2164  signal peptide protein  34.25 
 
 
210 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0709272  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2317  putative lipoprotein  33.12 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.927495  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2694  hypothetical protein  33.12 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>