40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6346 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6346  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1025  hypothetical protein  43.9 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0546  hypothetical protein  43.9 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0984  hypothetical protein  43.9 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295093  normal  0.1274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4138  hypothetical protein  43.29 
 
 
281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.955129  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0889  hypothetical protein  38.35 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0955  putative exported lipoprotein  37.02 
 
 
237 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833398  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0718  putative exported lipoprotein  46.67 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.261936  normal  0.297451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1662  putative signal peptide protein  37.44 
 
 
242 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2789  putative signal peptide protein  38.14 
 
 
242 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0031715  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0901  hypothetical protein  44.17 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3032  putative exported lipoprotein  37.8 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338968  decreased coverage  0.00314115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1715  putative signal peptide protein  39.63 
 
 
223 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1769  hypothetical protein  36.2 
 
 
237 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117921  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0126  hypothetical protein  36.2 
 
 
237 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000293987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1039  hypothetical protein  36.2 
 
 
237 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000138687  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1281  hypothetical protein  36.2 
 
 
243 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000955438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1953  hypothetical protein  36.2 
 
 
243 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000297307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2533  hypothetical protein  39.51 
 
 
243 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1777  hypothetical protein  35.75 
 
 
237 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1798  hypothetical protein  35.75 
 
 
237 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0851898  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4670  hypothetical protein  35.64 
 
 
233 aa  98.2  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574881  hitchhiker  0.00992931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1412  hypothetical protein  33.94 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0889401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1452  hypothetical protein  33.94 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1723  hypothetical protein  34.25 
 
 
236 aa  92  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0130536  hitchhiker  0.0000757016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1506  hypothetical protein  35.48 
 
 
236 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212232  hitchhiker  0.0000144009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1050  hypothetical protein  35.48 
 
 
236 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1530  hypothetical protein  35.48 
 
 
236 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4257  putative lipoprotein  33.94 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.14352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4367  putative lipoprotein  33.94 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11568  normal  0.560371 
 
 
-
 
NC_003296  RS02585  putative lipoprotein  36.05 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143555  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4717  hypothetical protein  28.37 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0538703  normal  0.011152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2329  hypothetical protein  43.62 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.09763  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2208  hypothetical protein  29.88 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1966  signal peptide protein  36.76 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.874063  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2366  putative signal peptide protein  33.12 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.369629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2164  signal peptide protein  31.82 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0709272  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2694  hypothetical protein  28.47 
 
 
212 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2317  putative lipoprotein  28.47 
 
 
258 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.927495  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  27.45 
 
 
1174 aa  45.8  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>