26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0686 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  100 
 
 		 148 aa  286  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  62.84 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  67.46 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  60.81 
 
 		 148 aa  173  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  60.81 
 
 		 148 aa  173  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  60.81 
 
 		 148 aa  167  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  60.81 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  66.67 
 
 		 152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  77.78 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  69.44 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  76.92 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  76.67 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  64.1 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  52.42 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  47.79 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  41.91 
 
 		 157 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  49.12 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  40.57 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  35.2 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  40.57 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  39.83 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  36.75 
 
 		 134 aa  67  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  32.82 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  34 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2754  hypothetical protein  28.1 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>