26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0850 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  276  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  83.8 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  46.02 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  42.74 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  47.27 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  44.64 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  44.64 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  45.87 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  46.43 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  46.43 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  56.19 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  45.19 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  46.9 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  45.13 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  46.36 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  45.13 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  47.79 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  39.23 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  39.42 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  31.25 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  39.6 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  35.34 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2754  hypothetical protein  32.35 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  32.43 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>