12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2754 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2754  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  289  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181294  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  33.09 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  28.97 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  32.35 
 
 
138 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  32.26 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  31.87 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  28.36 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  32.65 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>