25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3702 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  273  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  55.64 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  41.18 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  38.94 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  41.27 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  38.24 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  33.59 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  32.12 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  32.76 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  30.17 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  32.85 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  32.85 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  33.04 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  39.34 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  33.63 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  35.79 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  37.93 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  28.7 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  37.07 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  35.04 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  37 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  35.65 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>