26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4165 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  274  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  89.55 
 
 
134 aa  246  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  86.57 
 
 
134 aa  221  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  42.37 
 
 
134 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  39.29 
 
 
134 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  40.35 
 
 
140 aa  84  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  37.01 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  36.22 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  40.19 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  34.96 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  37.07 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  35.96 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  36 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  36 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  34.43 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  37.84 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  43.24 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  31.97 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  35.59 
 
 
138 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  40.57 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  35.14 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  35.14 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  36.27 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  29.2 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  34.23 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3925  hypothetical protein  34.33 
 
 
154 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>