21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0650 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2754  hypothetical protein  33.09 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181294  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  33.63 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  28.7 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  31.78 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  33.98 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  32.77 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  31.86 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  32.32 
 
 
148 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  32.32 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  30.77 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  30.7 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  30.48 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  31.76 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  29.2 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  31.31 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  31.31 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  30.83 
 
 
144 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  35.71 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  30.09 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>