26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3427 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  294  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  86.49 
 
 
148 aa  256  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  81.76 
 
 
148 aa  248  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  81.76 
 
 
148 aa  248  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  85.14 
 
 
148 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  76.35 
 
 
148 aa  205  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  62.88 
 
 
144 aa  165  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  65.55 
 
 
152 aa  164  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  62.84 
 
 
148 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  68.91 
 
 
149 aa  144  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  68.07 
 
 
149 aa  140  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  67.5 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  63.48 
 
 
120 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  47.9 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  50.88 
 
 
143 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  44.64 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  47.79 
 
 
157 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  52.17 
 
 
121 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  32.12 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  37.1 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  36.97 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  34.15 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  35.45 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  30.3 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  32.32 
 
 
134 aa  50.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2754  hypothetical protein  31.87 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>