26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2862 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  100 
 
 
120 aa  236  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  64.96 
 
 
144 aa  154  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  63.48 
 
 
148 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  64.35 
 
 
148 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  64.35 
 
 
148 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  63.48 
 
 
148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  60 
 
 
152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  62.61 
 
 
148 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  61.11 
 
 
148 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  66.67 
 
 
149 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  66.67 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  65.81 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  64.1 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  49.57 
 
 
140 aa  110  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  46.36 
 
 
138 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  48.31 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  45.95 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  39.34 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  52.63 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  40 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  38.24 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  36.27 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  36.27 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  33.04 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  35.71 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2754  hypothetical protein  30.53 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>