26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4182 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  295  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  86.49 
 
 
148 aa  256  8e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  85.81 
 
 
148 aa  256  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  85.81 
 
 
148 aa  256  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  83.78 
 
 
148 aa  236  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  79.73 
 
 
148 aa  205  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  61.31 
 
 
144 aa  167  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  65.55 
 
 
152 aa  163  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  73.04 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  60.4 
 
 
149 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  59.73 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  66.39 
 
 
149 aa  135  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  63.48 
 
 
120 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  47.76 
 
 
140 aa  114  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  51.79 
 
 
143 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  43.75 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  47.27 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  53.91 
 
 
121 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  35.71 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  37.4 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  36.36 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  36.36 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  34.21 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  29.55 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  32.32 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2754  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>