26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1430 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  83.8 
 
 		 138 aa  237  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  49.56 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  43.75 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  41.78 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  41.78 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  49.56 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  47.79 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  58.1 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  42.06 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  44.55 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  47.62 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  48.25 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  38.64 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  46.49 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  46.49 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  47.79 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  45.95 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  34.17 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  35.58 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  32.03 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  35.85 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  30.48 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2754  hypothetical protein  35.35 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>