35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0681 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  82.41 
 
 		 477 aa  787    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  68.92 
 
 		 468 aa  670    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  66.67 
 
 		 466 aa  661    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  983    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  69.43 
 
 		 472 aa  665    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  70.26 
 
 		 472 aa  693    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  82.21 
 
 		 477 aa  785    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  68.7 
 
 		 469 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  68.7 
 
 		 469 aa  673    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  82.41 
 
 		 477 aa  787    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  69.7 
 
 		 476 aa  671    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  69.9 
 
 		 476 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  69.6 
 
 		 491 aa  666    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  70.1 
 
 		 472 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  69.49 
 
 		 472 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  51.27 
 
 		 494 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  50.78 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  52.04 
 
 		 504 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  51.65 
 
 		 498 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  51.01 
 
 		 501 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  51.46 
 
 		 502 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  50.97 
 
 		 502 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  48.73 
 
 		 495 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  42.69 
 
 		 513 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  41.93 
 
 		 505 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4088  hypothetical protein  41.55 
 
 		 498 aa  332  9e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0335  hypothetical protein  41.34 
 
 		 498 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4171  hypothetical protein  43.6 
 
 		 498 aa  325  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  39.19 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  37.87 
 
 		 473 aa  256  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  34.06 
 
 		 494 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2757  hypothetical protein  40.82 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249947  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  30.71 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  25.36 
 
 		 419 aa  93.6  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  25 
 
 		 419 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>