35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2946 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1023    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  96.02 
 
 		 502 aa  954    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  68.06 
 
 		 504 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  51.19 
 
 		 477 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  50.79 
 
 		 477 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  50.99 
 
 		 477 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  49.9 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  49.22 
 
 		 472 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  50.97 
 
 		 489 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  48.42 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  48.63 
 
 		 476 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  48.43 
 
 		 476 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  49.31 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  48.62 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  47.68 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  49.71 
 
 		 466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  48.71 
 
 		 468 aa  448  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  47.83 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  47.64 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  48.3 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  47.87 
 
 		 491 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  47.22 
 
 		 498 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  47.6 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  40.42 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  39.85 
 
 		 505 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4088  hypothetical protein  39.37 
 
 		 498 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0335  hypothetical protein  39.17 
 
 		 498 aa  316  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4171  hypothetical protein  40.6 
 
 		 498 aa  316  8e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  35.67 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  35.67 
 
 		 473 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  31.97 
 
 		 494 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2757  hypothetical protein  41.2 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249947  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  32.42 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  30.15 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  30.04 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>