35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0504 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  70.46 
 
 
489 aa  669    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  70.33 
 
 
477 aa  660    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  69.72 
 
 
477 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  69.51 
 
 
477 aa  656    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  979    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  65.04 
 
 
466 aa  621  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  65.04 
 
 
472 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  65.72 
 
 
472 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  65.24 
 
 
468 aa  615  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  65.79 
 
 
469 aa  616  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  65.52 
 
 
476 aa  615  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  65.72 
 
 
476 aa  617  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  64.37 
 
 
472 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  64.98 
 
 
472 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  63.43 
 
 
469 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  52.29 
 
 
494 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  52.88 
 
 
498 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  48.53 
 
 
501 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  51.36 
 
 
504 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  48.48 
 
 
501 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  49.21 
 
 
502 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  49.03 
 
 
502 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  47.91 
 
 
495 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  41.7 
 
 
513 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0335  hypothetical protein  41.68 
 
 
498 aa  327  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  40.31 
 
 
505 aa  325  9e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4088  hypothetical protein  41.48 
 
 
498 aa  324  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4171  hypothetical protein  43.01 
 
 
498 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  38.2 
 
 
473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  37.3 
 
 
473 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  33.85 
 
 
494 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2757  hypothetical protein  33.8 
 
 
484 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249947  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  31.03 
 
 
437 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  27.21 
 
 
419 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  27.47 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>