32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2757 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2757  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  972    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249947  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  35.49 
 
 
473 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  38.44 
 
 
513 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  34.43 
 
 
491 aa  194  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  42.86 
 
 
505 aa  193  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  34.84 
 
 
472 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  33.88 
 
 
476 aa  193  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  33.88 
 
 
476 aa  193  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  35.02 
 
 
469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  34.37 
 
 
466 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  32.57 
 
 
501 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  34.51 
 
 
472 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  32.1 
 
 
495 aa  189  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  42.68 
 
 
473 aa  189  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  34.13 
 
 
489 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  33.55 
 
 
472 aa  188  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  33.62 
 
 
472 aa  187  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  34.23 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  34.22 
 
 
468 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  41.2 
 
 
502 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  41.2 
 
 
502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  30.31 
 
 
498 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  28.98 
 
 
494 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  42.8 
 
 
501 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  41.87 
 
 
504 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  29.7 
 
 
494 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  32.62 
 
 
477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  31.46 
 
 
477 aa  172  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  31.46 
 
 
477 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  37.04 
 
 
437 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  34.62 
 
 
419 aa  144  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  33.86 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>