35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0437 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  67.78 
 
 
477 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  88.46 
 
 
468 aa  845    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  100 
 
 
466 aa  956    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  66.67 
 
 
489 aa  651    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  78.06 
 
 
472 aa  743    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  68.92 
 
 
472 aa  664    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  67.15 
 
 
477 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  78.13 
 
 
469 aa  723    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  79.41 
 
 
469 aa  763    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  67.98 
 
 
477 aa  646    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  77.41 
 
 
476 aa  737    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  77.41 
 
 
476 aa  737    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  78.27 
 
 
472 aa  751    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  78.9 
 
 
472 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  64.63 
 
 
491 aa  616  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  52.51 
 
 
494 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  51.76 
 
 
498 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  48.5 
 
 
501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  49.7 
 
 
502 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  49.71 
 
 
502 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  49.11 
 
 
504 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  50.76 
 
 
501 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  47.59 
 
 
495 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  40.89 
 
 
505 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  42.06 
 
 
513 aa  356  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0335  hypothetical protein  40.85 
 
 
498 aa  317  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4088  hypothetical protein  40.65 
 
 
498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4171  hypothetical protein  42.42 
 
 
498 aa  312  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  38.41 
 
 
473 aa  300  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  36.61 
 
 
473 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  34.51 
 
 
494 aa  256  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2757  hypothetical protein  32.82 
 
 
484 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249947  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  26.79 
 
 
437 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  30.55 
 
 
419 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  29.47 
 
 
419 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>