35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59920 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  67.4 
 
 
495 aa  668    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  99 
 
 
501 aa  1012    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  100 
 
 
501 aa  1019    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  57.03 
 
 
494 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  58.11 
 
 
498 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  50.78 
 
 
489 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  50.59 
 
 
477 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  50 
 
 
477 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  49.71 
 
 
472 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  49.61 
 
 
477 aa  458  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  49.9 
 
 
472 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  49.5 
 
 
469 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  48.24 
 
 
491 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  48.7 
 
 
468 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  48.3 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  48.5 
 
 
472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  49 
 
 
472 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  48.65 
 
 
502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  47.68 
 
 
502 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  48.32 
 
 
476 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  48.32 
 
 
476 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  46.71 
 
 
504 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  46.71 
 
 
469 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  41.67 
 
 
513 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  38.14 
 
 
505 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4088  hypothetical protein  41.5 
 
 
498 aa  316  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0335  hypothetical protein  41.11 
 
 
498 aa  314  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4171  hypothetical protein  43.35 
 
 
498 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  35.53 
 
 
473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  35.01 
 
 
494 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  32.75 
 
 
473 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2757  hypothetical protein  42.8 
 
 
484 aa  177  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249947  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  32.2 
 
 
437 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  29.12 
 
 
419 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  29.12 
 
 
419 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>