35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1444 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  91.16 
 
 		 498 aa  858    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  999    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  60.24 
 
 		 495 aa  598  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  58.22 
 
 		 501 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  58.52 
 
 		 501 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  53.19 
 
 		 477 aa  508  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  52.91 
 
 		 477 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  53.01 
 
 		 477 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  52.51 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  52.11 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  52.04 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  51.2 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  50 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  49.7 
 
 		 472 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  50.1 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  50.7 
 
 		 469 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  51.3 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  49.5 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  49.5 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  49.7 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  48.84 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  49.6 
 
 		 502 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  48.3 
 
 		 502 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  42.53 
 
 		 513 aa  369  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  39.77 
 
 		 505 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4088  hypothetical protein  40.89 
 
 		 498 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0335  hypothetical protein  40.24 
 
 		 498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4171  hypothetical protein  41.72 
 
 		 498 aa  305  9.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  37.03 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  34.96 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  32.84 
 
 		 494 aa  237  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2757  hypothetical protein  37.2 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249947  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  31.54 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  28.68 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  27.99 
 
 		 419 aa  94.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>