35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2390 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  905    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  53.81 
 
 
419 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  54.26 
 
 
419 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2757  hypothetical protein  37.04 
 
 
484 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249947  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  35.69 
 
 
473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  36.72 
 
 
505 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  34.27 
 
 
473 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0335  hypothetical protein  26.73 
 
 
498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4088  hypothetical protein  26.37 
 
 
498 aa  130  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  34.68 
 
 
513 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4171  hypothetical protein  33.83 
 
 
498 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  26.79 
 
 
466 aa  118  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  30.71 
 
 
489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  25.81 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  31.06 
 
 
504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  31.37 
 
 
502 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  32.96 
 
 
495 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  31 
 
 
498 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  31.31 
 
 
494 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  31.64 
 
 
502 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  30.42 
 
 
472 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  28.82 
 
 
477 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  30.61 
 
 
468 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  29.51 
 
 
477 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  30.53 
 
 
477 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  29.08 
 
 
472 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  30.53 
 
 
491 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  28.69 
 
 
469 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  28.24 
 
 
472 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  28.52 
 
 
472 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  28.51 
 
 
469 aa  96.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  32.2 
 
 
501 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  32.2 
 
 
501 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  28.09 
 
 
476 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  28.09 
 
 
476 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>