35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0658 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1039    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  65 
 
 		 505 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4088  hypothetical protein  52.98 
 
 		 498 aa  487  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0335  hypothetical protein  52.78 
 
 		 498 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4171  hypothetical protein  52.98 
 
 		 498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  43.55 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  43.34 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  43.17 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  43.64 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  42.06 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  43.45 
 
 		 472 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  42.88 
 
 		 489 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  44.13 
 
 		 498 aa  359  8e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  41.95 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  42.46 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  42.46 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  42.94 
 
 		 469 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  41.7 
 
 		 491 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  42.51 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  41.86 
 
 		 501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  43.99 
 
 		 501 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  41.81 
 
 		 495 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  42.07 
 
 		 477 aa  345  8.999999999999999e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  40.46 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  40.85 
 
 		 502 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  42.27 
 
 		 477 aa  342  9e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  42.27 
 
 		 477 aa  342  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  40.77 
 
 		 502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  42.27 
 
 		 473 aa  320  5e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  37.42 
 
 		 473 aa  293  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  34.15 
 
 		 494 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2757  hypothetical protein  44.9 
 
 		 484 aa  206  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249947  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 419 aa  143  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 419 aa  143  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  34.68 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>