25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0640 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0640  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  832    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0168181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0995  hypothetical protein  77.75 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2336  hypothetical protein  76.56 
 
 		 400 aa  551  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.342455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4146  hypothetical protein  65.71 
 
 		 414 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924628  hitchhiker  0.00153424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1315  hypothetical protein  67.72 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1449  hypothetical protein  67.72 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2294  hypothetical protein  66.43 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00294727  hitchhiker  0.000134902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3381  hypothetical protein  66.75 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1227  hypothetical protein  65.56 
 
 		 414 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914042  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0476  hypothetical protein  59.86 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1662  hypothetical protein  59.62 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0554031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2817  hypothetical protein  64.27 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0563  hypothetical protein  62.41 
 
 		 411 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2997  hypothetical protein  48.36 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1525  hypothetical protein  46.2 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0641045  normal  0.0989944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59100  hypothetical protein  42.52 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130584  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4456  hypothetical protein  41.8 
 
 		 443 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3289  hypothetical protein  38.95 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2917  hypothetical protein  39.35 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4110  hypothetical protein  34.12 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0307  hypothetical protein  33.92 
 
 		 423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000564448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0616  hypothetical protein  30.75 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3743  hypothetical protein  31.56 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0621  hypothetical protein  41.67 
 
 		 419 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1723  hypothetical protein  28.65 
 
 		 409 aa  96.3  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>