25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1662 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1662  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  827    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0554031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0476  hypothetical protein  87.62 
 
 
404 aa  681    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0995  hypothetical protein  61.94 
 
 
397 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4146  hypothetical protein  54.81 
 
 
414 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924628  hitchhiker  0.00153424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2294  hypothetical protein  58.48 
 
 
412 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00294727  hitchhiker  0.000134902 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1315  hypothetical protein  59.16 
 
 
411 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1449  hypothetical protein  59.16 
 
 
411 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0640  hypothetical protein  61.35 
 
 
419 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0168181 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2817  hypothetical protein  59.25 
 
 
401 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1227  hypothetical protein  54.79 
 
 
414 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914042  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3381  hypothetical protein  55.39 
 
 
416 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.101436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2336  hypothetical protein  57.92 
 
 
400 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.342455  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0563  hypothetical protein  56.78 
 
 
411 aa  342  8e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2997  hypothetical protein  48.7 
 
 
396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423399  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1525  hypothetical protein  42.03 
 
 
457 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0641045  normal  0.0989944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59100  hypothetical protein  39.21 
 
 
441 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130584  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4456  hypothetical protein  39.9 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3289  hypothetical protein  35.99 
 
 
405 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2917  hypothetical protein  36.21 
 
 
405 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4110  hypothetical protein  31.09 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437202  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0307  hypothetical protein  30.47 
 
 
423 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000564448 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3743  hypothetical protein  30.7 
 
 
399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0616  hypothetical protein  44.3 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0621  hypothetical protein  34.38 
 
 
419 aa  103  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1723  hypothetical protein  26.29 
 
 
409 aa  89.7  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>