25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0621 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0621  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  871    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3743  hypothetical protein  38.46 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0307  hypothetical protein  35.94 
 
 
423 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000564448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1525  hypothetical protein  28.85 
 
 
457 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0641045  normal  0.0989944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4456  hypothetical protein  26.57 
 
 
443 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0616  hypothetical protein  34.52 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59100  hypothetical protein  32.38 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130584  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4110  hypothetical protein  39.52 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437202  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4146  hypothetical protein  36.26 
 
 
414 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924628  hitchhiker  0.00153424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2997  hypothetical protein  27.11 
 
 
396 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423399  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1662  hypothetical protein  26.15 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0554031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0476  hypothetical protein  34.07 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1723  hypothetical protein  40 
 
 
409 aa  92.8  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3289  hypothetical protein  24.48 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2294  hypothetical protein  37.36 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00294727  hitchhiker  0.000134902 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1449  hypothetical protein  42.07 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1315  hypothetical protein  42.07 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0995  hypothetical protein  38.75 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0640  hypothetical protein  41.67 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0168181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2917  hypothetical protein  23.86 
 
 
405 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3381  hypothetical protein  28.19 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.101436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1227  hypothetical protein  40.43 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914042  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0563  hypothetical protein  37.84 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2336  hypothetical protein  37.28 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.342455  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2817  hypothetical protein  36.36 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>