25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2294 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2294  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  825    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00294727  hitchhiker  0.000134902 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1315  hypothetical protein  92.75 
 
 		 411 aa  728    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1449  hypothetical protein  92.75 
 
 		 411 aa  728    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4146  hypothetical protein  82.52 
 
 		 414 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924628  hitchhiker  0.00153424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1227  hypothetical protein  80.77 
 
 		 414 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914042  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3381  hypothetical protein  80.58 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0995  hypothetical protein  70.37 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2336  hypothetical protein  69.53 
 
 		 400 aa  481  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.342455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0640  hypothetical protein  70.27 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0168181 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2817  hypothetical protein  61.63 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1662  hypothetical protein  58.29 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0554031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0476  hypothetical protein  58.29 
 
 		 404 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0563  hypothetical protein  61.73 
 
 		 411 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2997  hypothetical protein  48.32 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59100  hypothetical protein  41.86 
 
 		 441 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130584  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4456  hypothetical protein  41.86 
 
 		 443 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1525  hypothetical protein  45.95 
 
 		 457 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0641045  normal  0.0989944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3289  hypothetical protein  36.84 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2917  hypothetical protein  37.67 
 
 		 405 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4110  hypothetical protein  37.14 
 
 		 415 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0307  hypothetical protein  34.24 
 
 		 423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000564448 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3743  hypothetical protein  34.53 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0616  hypothetical protein  40.09 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1723  hypothetical protein  30.23 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0621  hypothetical protein  37.91 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>