25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1227 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3381  hypothetical protein  89.9 
 
 
416 aa  679    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.101436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1227  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  835    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914042  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2294  hypothetical protein  80.62 
 
 
412 aa  627  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00294727  hitchhiker  0.000134902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4146  hypothetical protein  76.5 
 
 
414 aa  622  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924628  hitchhiker  0.00153424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1315  hypothetical protein  79.9 
 
 
411 aa  617  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1449  hypothetical protein  79.9 
 
 
411 aa  617  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0995  hypothetical protein  70.02 
 
 
397 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2336  hypothetical protein  69.51 
 
 
400 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.342455  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0640  hypothetical protein  70.32 
 
 
419 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0168181 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2817  hypothetical protein  64.48 
 
 
401 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0476  hypothetical protein  56.97 
 
 
404 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1662  hypothetical protein  56.86 
 
 
404 aa  408  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0554031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0563  hypothetical protein  61.43 
 
 
411 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2997  hypothetical protein  49.85 
 
 
396 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423399  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1525  hypothetical protein  48.28 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0641045  normal  0.0989944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59100  hypothetical protein  39.65 
 
 
441 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130584  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4456  hypothetical protein  38.8 
 
 
443 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3289  hypothetical protein  38.19 
 
 
405 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2917  hypothetical protein  38.11 
 
 
405 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3743  hypothetical protein  32.68 
 
 
399 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4110  hypothetical protein  34.11 
 
 
415 aa  159  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437202  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0307  hypothetical protein  36.8 
 
 
423 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000564448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0616  hypothetical protein  43.48 
 
 
432 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1723  hypothetical protein  31.44 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0621  hypothetical protein  40.43 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>