38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0329 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0329  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  218  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.12516  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3526  hypothetical protein  47.66 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510354 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2028  hypothetical protein  51.89 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0739  hypothetical protein  51.89 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4369  hypothetical protein  46.73 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6403  hypothetical protein  45.37 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.298397 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3997  hypothetical protein  46.73 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6108  hypothetical protein  45.37 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0349  hypothetical protein  44.86 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4388  hypothetical protein  45.79 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4576  hypothetical protein  52.38 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.748225 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0763  hypothetical protein  43.52 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3826  hypothetical protein  52.83 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.694532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0338  hypothetical protein  42.06 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0622  hypothetical protein  40.19 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0766  hypothetical protein  40.19 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1753  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160247  normal  0.158742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3350  hypothetical protein  40.74 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3489  hypothetical protein  40.74 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5173  hypothetical protein  40.95 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4239  hypothetical protein  32.38 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1485  hypothetical protein  36.45 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0883  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2578  hypothetical protein  40.78 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0877  hypothetical protein  36.19 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3850  hypothetical protein  31.43 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726814  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0367  hypothetical protein  40.74 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5049  hypothetical protein  38.32 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3509  hypothetical protein  38.95 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416382 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4752  hypothetical protein  37.38 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4664  hypothetical protein  37.38 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0931  hypothetical protein  37.5 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2530  hypothetical protein  34.62 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2171  hypothetical protein  32.71 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2734  hypothetical protein  28.42 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0238384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0043  ketosteroid isomerase-like protein  27.52 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0379444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3246  hypothetical protein  25.81 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.178878  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4162  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>