38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4576 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4576  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  215  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.748225 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0739  hypothetical protein  71.43 
 
 		 107 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2028  hypothetical protein  71.43 
 
 		 107 aa  160  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3826  hypothetical protein  78.1 
 
 		 106 aa  137  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.694532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3526  hypothetical protein  45.71 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510354 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4369  hypothetical protein  44.76 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3997  hypothetical protein  44.76 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0367  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6403  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.298397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0349  hypothetical protein  43.4 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0329  hypothetical protein  52.38 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.12516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4239  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6108  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0338  hypothetical protein  41.9 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0622  hypothetical protein  40.95 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0766  hypothetical protein  40.95 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4388  hypothetical protein  40.95 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3850  hypothetical protein  35.24 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0877  hypothetical protein  37.14 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3350  hypothetical protein  41.9 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0763  hypothetical protein  39.05 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1753  hypothetical protein  39.39 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160247  normal  0.158742 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5173  hypothetical protein  42.31 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3489  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695111 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1485  hypothetical protein  39.42 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0883  hypothetical protein  37.14 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5049  hypothetical protein  39.05 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4752  hypothetical protein  38.68 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4664  hypothetical protein  38.68 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2530  hypothetical protein  37.14 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2578  hypothetical protein  37.08 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3509  hypothetical protein  35.58 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3246  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.178878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0931  hypothetical protein  35.78 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2807  hypothetical protein  31.78 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.249118  normal  0.281052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2734  hypothetical protein  28.85 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0238384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2171  hypothetical protein  27.62 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4162  hypothetical protein  33.65 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>