27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2734 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2734  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  236  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0238384  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2530  hypothetical protein  52.68 
 
 
117 aa  117  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3509  hypothetical protein  51.89 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0416382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4664  hypothetical protein  46.23 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5049  hypothetical protein  47.62 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4752  hypothetical protein  46.23 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0931  hypothetical protein  46.79 
 
 
116 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4162  hypothetical protein  45.28 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0766  hypothetical protein  36.19 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0622  hypothetical protein  36.19 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3997  hypothetical protein  33.65 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103649  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4369  hypothetical protein  33.65 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3526  hypothetical protein  32.69 
 
 
117 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.510354 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6403  hypothetical protein  30.56 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.298397 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3350  hypothetical protein  29.36 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6108  hypothetical protein  29.63 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0883  hypothetical protein  26.61 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949761  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0338  hypothetical protein  32.69 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4388  hypothetical protein  30.77 
 
 
108 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0877  hypothetical protein  23.85 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852856  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1753  hypothetical protein  30 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160247  normal  0.158742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3489  hypothetical protein  28.04 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.695111 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1485  hypothetical protein  27.88 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0329  hypothetical protein  28.42 
 
 
109 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.12516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4239  hypothetical protein  23.08 
 
 
107 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157952  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0349  hypothetical protein  26.67 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4576  hypothetical protein  28.85 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.748225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>