38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0349 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0349  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  226  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0338  hypothetical protein  55.14 
 
 
108 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0622  hypothetical protein  53.7 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0766  hypothetical protein  53.7 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6403  hypothetical protein  49.53 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.298397 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6108  hypothetical protein  49.53 
 
 
108 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3997  hypothetical protein  45.79 
 
 
123 aa  103  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103649  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4369  hypothetical protein  45.79 
 
 
123 aa  103  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3526  hypothetical protein  45.79 
 
 
117 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.510354 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0763  hypothetical protein  41.12 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4388  hypothetical protein  46.73 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3350  hypothetical protein  45.37 
 
 
108 aa  94  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1485  hypothetical protein  43.12 
 
 
113 aa  93.6  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5173  hypothetical protein  43.27 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135644  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3489  hypothetical protein  43.52 
 
 
108 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.695111 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0739  hypothetical protein  40.95 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2028  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0329  hypothetical protein  44.86 
 
 
109 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.12516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0367  hypothetical protein  40.95 
 
 
106 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4576  hypothetical protein  43.4 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.748225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0883  hypothetical protein  38.68 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949761  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0877  hypothetical protein  37.74 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852856  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3826  hypothetical protein  39.05 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.694532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4239  hypothetical protein  30.19 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157952  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1753  hypothetical protein  40.4 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160247  normal  0.158742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5049  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4752  hypothetical protein  39.05 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4664  hypothetical protein  39.05 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2530  hypothetical protein  34.58 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3850  hypothetical protein  32.08 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2578  hypothetical protein  34.74 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3509  hypothetical protein  33.65 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0416382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0931  hypothetical protein  39.08 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2171  hypothetical protein  29.91 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0359  hypothetical protein  30.28 
 
 
108 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3246  hypothetical protein  29.91 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.178878  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0933  hypothetical protein  26.36 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2734  hypothetical protein  26.67 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0238384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>