34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0367 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0367  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  218  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2028  hypothetical protein  40.95 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0739  hypothetical protein  40.95 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0766  hypothetical protein  41.75 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0622  hypothetical protein  41.75 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3526  hypothetical protein  40.78 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510354 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3826  hypothetical protein  44.76 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.694532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0349  hypothetical protein  40.95 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6403  hypothetical protein  38.1 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.298397 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6108  hypothetical protein  39.05 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1753  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160247  normal  0.158742 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3997  hypothetical protein  37.86 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4369  hypothetical protein  37.86 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0763  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4576  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.748225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4388  hypothetical protein  43.27 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3489  hypothetical protein  40.78 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0338  hypothetical protein  40.95 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4239  hypothetical protein  34.29 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3350  hypothetical protein  39.05 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3850  hypothetical protein  31.43 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0877  hypothetical protein  32.38 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1485  hypothetical protein  34.91 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2578  hypothetical protein  39.81 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5173  hypothetical protein  36.79 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0329  hypothetical protein  37.14 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.12516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0883  hypothetical protein  30.48 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3509  hypothetical protein  35.58 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0931  hypothetical protein  31.78 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2530  hypothetical protein  31.73 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5049  hypothetical protein  32.69 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4752  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4664  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2171  hypothetical protein  30.53 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.513143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>