37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4239 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4239  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  224  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3850  hypothetical protein  51.4 
 
 		 107 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0883  hypothetical protein  45.79 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0877  hypothetical protein  41.12 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0622  hypothetical protein  34.91 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0766  hypothetical protein  34.91 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4576  hypothetical protein  38.1 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.748225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0367  hypothetical protein  34.29 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2028  hypothetical protein  33.64 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0739  hypothetical protein  33.64 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3826  hypothetical protein  38.1 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.694532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3997  hypothetical protein  32.04 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0349  hypothetical protein  30.19 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4369  hypothetical protein  32.04 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3526  hypothetical protein  32.04 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3350  hypothetical protein  30.84 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0763  hypothetical protein  32.38 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4388  hypothetical protein  32.38 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0338  hypothetical protein  31.78 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1485  hypothetical protein  33.65 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0329  hypothetical protein  39.19 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.12516  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5173  hypothetical protein  33.65 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6403  hypothetical protein  32.38 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.298397 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6108  hypothetical protein  32.38 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1753  hypothetical protein  36.59 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160247  normal  0.158742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3489  hypothetical protein  27.88 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2530  hypothetical protein  24.76 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2171  hypothetical protein  26.67 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2578  hypothetical protein  28.85 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5049  hypothetical protein  29.91 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0043  ketosteroid isomerase-like protein  32.61 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0379444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3509  hypothetical protein  26.92 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0931  hypothetical protein  26.17 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2734  hypothetical protein  23.08 
 
 		 119 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0238384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4752  hypothetical protein  25.71 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4664  hypothetical protein  25.71 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0359  hypothetical protein  25.96 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>