37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4388 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4388  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6108  hypothetical protein  48.6 
 
 		 108 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6403  hypothetical protein  47.66 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.298397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0349  hypothetical protein  46.73 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0338  hypothetical protein  47.17 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4369  hypothetical protein  48.15 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3997  hypothetical protein  48.15 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5173  hypothetical protein  45.19 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3526  hypothetical protein  48.15 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3350  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0766  hypothetical protein  41.82 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0622  hypothetical protein  41.82 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2530  hypothetical protein  42.2 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0329  hypothetical protein  45.79 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.12516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0739  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2028  hypothetical protein  39.05 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0367  hypothetical protein  43.27 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0763  hypothetical protein  39.25 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1753  hypothetical protein  40.4 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160247  normal  0.158742 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4576  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.748225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4239  hypothetical protein  32.38 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3850  hypothetical protein  37.35 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3489  hypothetical protein  43.27 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3509  hypothetical protein  36.79 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416382 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3826  hypothetical protein  37.14 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.694532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1485  hypothetical protein  36.11 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0883  hypothetical protein  35.63 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5049  hypothetical protein  37.74 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4752  hypothetical protein  40.96 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4664  hypothetical protein  40.96 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2578  hypothetical protein  31.43 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0931  hypothetical protein  33.63 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2171  hypothetical protein  31.19 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2734  hypothetical protein  30.77 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0238384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0043  ketosteroid isomerase-like protein  28.7 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0379444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4162  hypothetical protein  35.44 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>