33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2171 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2171  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  217  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1485  hypothetical protein  37.96 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0622  hypothetical protein  34.86 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0766  hypothetical protein  34.86 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2578  hypothetical protein  31.07 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0763  hypothetical protein  35.78 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6108  hypothetical protein  29.91 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2028  hypothetical protein  30.48 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0739  hypothetical protein  30.48 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6403  hypothetical protein  34.26 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.298397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0338  hypothetical protein  32.71 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0349  hypothetical protein  29.91 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4239  hypothetical protein  26.67 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1753  hypothetical protein  35.51 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160247  normal  0.158742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4369  hypothetical protein  31.78 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3997  hypothetical protein  31.78 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3526  hypothetical protein  31.78 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4388  hypothetical protein  31.19 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3489  hypothetical protein  31.78 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0359  hypothetical protein  34.74 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5173  hypothetical protein  31.52 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3850  hypothetical protein  24.76 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4752  hypothetical protein  32.14 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0883  hypothetical protein  27.36 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4664  hypothetical protein  32.14 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3826  hypothetical protein  35.14 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.694532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0877  hypothetical protein  25.47 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5049  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3246  hypothetical protein  28.04 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.178878  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3350  hypothetical protein  30.84 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1957  hypothetical protein  32.93 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0367  hypothetical protein  30.53 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2083  steroid delta-isomerase domain-containing protein  35.48 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>