23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3246 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3246  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.178878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0359  hypothetical protein  51.49 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0933  hypothetical protein  48.54 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0043  ketosteroid isomerase-like protein  28.16 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0379444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1957  hypothetical protein  34.04 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0739  hypothetical protein  32.08 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2028  hypothetical protein  32.08 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6403  hypothetical protein  30.84 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.298397 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6108  hypothetical protein  28.97 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4369  hypothetical protein  29.63 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3997  hypothetical protein  29.63 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3489  hypothetical protein  30.84 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3526  hypothetical protein  28.7 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1485  hypothetical protein  28.97 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2803  hypothetical protein  43.4 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.459087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0349  hypothetical protein  29.91 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0338  hypothetical protein  35.19 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2171  hypothetical protein  28.04 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2807  hypothetical protein  29.91 
 
 		 122 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.249118  normal  0.281052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5173  hypothetical protein  34.44 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0622  hypothetical protein  29.79 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0766  hypothetical protein  29.79 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5049  hypothetical protein  28.85 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>