38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0766 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0766  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  229  9e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0622  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  229  9e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0338  hypothetical protein  62.96 
 
 
108 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0349  hypothetical protein  53.7 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6108  hypothetical protein  46.3 
 
 
108 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6403  hypothetical protein  45.37 
 
 
108 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.298397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4369  hypothetical protein  45.79 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3997  hypothetical protein  45.79 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103649  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3526  hypothetical protein  45.79 
 
 
117 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.510354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3350  hypothetical protein  49.06 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0763  hypothetical protein  40.74 
 
 
108 aa  96.7  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1485  hypothetical protein  40.19 
 
 
113 aa  90.9  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0367  hypothetical protein  41.75 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3489  hypothetical protein  42.06 
 
 
108 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.695111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5173  hypothetical protein  40.95 
 
 
122 aa  87.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135644  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4388  hypothetical protein  41.82 
 
 
108 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4239  hypothetical protein  34.91 
 
 
107 aa  83.6  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157952  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2530  hypothetical protein  41.96 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1753  hypothetical protein  41.12 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160247  normal  0.158742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2578  hypothetical protein  40 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3850  hypothetical protein  31.13 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0877  hypothetical protein  34.29 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852856  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0883  hypothetical protein  34.29 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949761  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4752  hypothetical protein  39.62 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4664  hypothetical protein  39.62 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2028  hypothetical protein  33.98 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0739  hypothetical protein  33.98 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3826  hypothetical protein  40.57 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.694532 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4576  hypothetical protein  40.95 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.748225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5049  hypothetical protein  38.68 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0329  hypothetical protein  40.19 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.12516  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3509  hypothetical protein  37.74 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0416382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0931  hypothetical protein  37.27 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2171  hypothetical protein  34.86 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2734  hypothetical protein  36.19 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0238384  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4162  hypothetical protein  37.96 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0933  hypothetical protein  27.1 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3246  hypothetical protein  29.79 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.178878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>