23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3458 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3301  transmembrane protein  68.84 
 
 		 503 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00618037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3458  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1055    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05340  hypothetical protein  43.69 
 
 		 482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4235  hypothetical protein  43.69 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4123  putative transmembrane protein  43.69 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0819  hypothetical protein  47.24 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307311  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5396  hypothetical protein  47 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3476  hypothetical protein  47 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286705  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4890  hypothetical protein  47 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4270  hypothetical protein  47.13 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132934  normal  0.0630852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4797  hypothetical protein  42.19 
 
 		 485 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.248182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3751  hypothetical protein  37.04 
 
 		 643 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4098  putative transmembrane protein  33.64 
 
 		 498 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3448  putative transmembrane protein  33.64 
 
 		 498 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4739  putative transmembrane protein  34.08 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0247  hypothetical protein  36.48 
 
 		 545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4788  putative transmembrane protein  34.03 
 
 		 510 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570342  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5268  putative transmembrane protein  31.98 
 
 		 493 aa  217  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0107  hypothetical protein  38.21 
 
 		 210 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0108  hypothetical protein  28.7 
 
 		 440 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713971  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1572  hypothetical protein  23.5 
 
 		 634 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0854  hypothetical protein  22.39 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0853  hypothetical protein  25.9 
 
 		 211 aa  47.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120115  normal  0.141746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>