22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4797 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4797  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  982    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.248182  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0819  hypothetical protein  88.22 
 
 
505 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307311  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5396  hypothetical protein  87.63 
 
 
505 aa  818    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4890  hypothetical protein  87.63 
 
 
505 aa  818    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4270  hypothetical protein  98.35 
 
 
506 aa  938    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132934  normal  0.0630852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3476  hypothetical protein  87.63 
 
 
505 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286705  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3301  transmembrane protein  41.82 
 
 
503 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00618037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3458  hypothetical protein  46.14 
 
 
514 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4123  putative transmembrane protein  41.16 
 
 
481 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4235  hypothetical protein  41.16 
 
 
481 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05340  hypothetical protein  40.83 
 
 
482 aa  343  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3751  hypothetical protein  34.22 
 
 
643 aa  240  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5268  putative transmembrane protein  32.84 
 
 
493 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4788  putative transmembrane protein  32.72 
 
 
510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570342  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3448  putative transmembrane protein  32.36 
 
 
498 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4098  putative transmembrane protein  31.87 
 
 
498 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0247  hypothetical protein  35.25 
 
 
545 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4739  putative transmembrane protein  31.49 
 
 
528 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0107  hypothetical protein  39.18 
 
 
210 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0108  hypothetical protein  33.67 
 
 
440 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713971  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1572  hypothetical protein  25.45 
 
 
634 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0854  hypothetical protein  25.71 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.161189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>