28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0247 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0247  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1094    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5268  putative transmembrane protein  48.84 
 
 		 493 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54014  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4739  putative transmembrane protein  44.89 
 
 		 528 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3448  putative transmembrane protein  46.74 
 
 		 498 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4098  putative transmembrane protein  46.53 
 
 		 498 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4788  putative transmembrane protein  41.34 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570342  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3458  hypothetical protein  36.68 
 
 		 514 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3301  transmembrane protein  36.76 
 
 		 503 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00618037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3751  hypothetical protein  35.09 
 
 		 643 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5396  hypothetical protein  37.61 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3476  hypothetical protein  37.61 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286705  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4890  hypothetical protein  37.61 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0819  hypothetical protein  36.56 
 
 		 505 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307311  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4270  hypothetical protein  36.23 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132934  normal  0.0630852 
 
 
-
 
NC_003296  RS05340  hypothetical protein  35.99 
 
 		 482 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4123  putative transmembrane protein  34.08 
 
 		 481 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4235  hypothetical protein  34.08 
 
 		 481 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4797  hypothetical protein  35.94 
 
 		 485 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.248182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0107  hypothetical protein  33.8 
 
 		 210 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0108  hypothetical protein  30.92 
 
 		 440 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713971  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1572  hypothetical protein  23.84 
 
 		 634 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0853  hypothetical protein  27.8 
 
 		 211 aa  72.4  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120115  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 		 714 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 		 714 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 		 714 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 		 714 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.43 
 
 		 714 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  31.43 
 
 		 714 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>